Titulaire d'un doctorat en Musicologie du XXe siècle à l'EHESS réalisé sous la direction de Hugues Dufourt, Didier Guigue est professeur à l'Université Fédérale de Paraíba (João Pessoa, Brésil), où il assume également la direction d'un Troisième cycle en Musique. Chercheur au CNPQ (Conseil Brésilien pour la Recherche Scientifique) et à l'OMF (Paris-IV-Sorbonne), il dirige le Mus3, un Groupe de recherches interdisciplinaires intégrant la musicologie systématique, la théorie musicale et l'informatique, qui possède une convention de recherche avec l'IRCAM.
Bien que concentrée pour l'essentiel au Brésil où, avec un petit groupe de collègues, il s'efforce, dans un milieu où l'industrie de masse tend à tenir lieu de culture musicale, de faire circuler idées, débats et créateurs, sa bibliographie inclut des publications en Europe et aux Etats-Unis. Son activité compositionnelle, qu'il préfère considérer comme un hobby, est centrée sur des productions dans l'univers des musiques numériques