Mohammed Arkoun est le père de l’islamologie appliquée. Grâce à cette discipline et ses concepts, il propose une analyse rigoureuse et exigeante des sociétés en contextes islamiques et de leurs rapports avec d’autres. 
Il aboutit ainsi à la nécessité de l’instauration d’un humanisme universalisable, seul gage pour une paix véritable et durable. En mettant à la portée du penseur-chercheur une nouvelle approche méthodologique qui vise une compréhension plus équilibrée de l’histoire, il rejette les volontés d’hégémonie et prend en compte toutes les composantes de la société humaine. 
Par la méthode de déconstruction-remembrement de la pensée islamique en particulier et de la pensée humaine en général, il entend libérer l’humanité des clôtures dogmatiques et promouvoir un humanisme universalisable.